U Arboretumu su izdvojene četiri vrste tala: smeđa karbonatna tla, humizirane crvenice, crnice i apsolutno skeletna salinizirana tla. Smeđa karbonatna tla pokrivaju najveći dio Arboretuma i razvijena su na flišu, tvrdim vapnencima i u vrlo maloj mjeri na sedri. Humizirane crvenice rasprostranjene su u dva ograničena areala u zapadnom dijelu Arboretuma. One se razvijaju na tvrdim vapnencima te se u skladu sa strukturom razlikuje skeletni i skeletoidni tip. Crnice nastaju prirodnom humizacijom na obronku strmca iznad mora, a antropogene crnice nastale su dugom i intenzivnom kultivacijom i gnojenjem tla. Apsolutno skeletna i salinizirana tla, kao vrlo uski kameniti pojas, protežu se obalom neposredno iznad razine mora, uključujući litoral i supralitoral na kome je razvijena halofitna vegetacija obalnih grebena.
